Комментарий к прологу
в 862 году — согласно «Повести временных лет» в 862 году племена словен, чуди, мери и кривичей решили призвать на княжение в Новгород варягов. Эта дата, традиционно считающаяся началом русской государственности, как и вся древнейшая хронология «Повести временных лет» является результатом искусственных калькуляций и исторически малодостоверна.
Ангел (др.-греч. ἄγγελος, ангелос — «вестник», «посланец») — духовное, бесплотное существо, сообщающее волю Бога и обладающее сверхъестественными возможностями.
С приставкой «архи» (др.-греч. ἀρχι — «главный») — Архангел (здесь только для обозначения субординации, без связи с библейскими канонами).
Василий — возможно, здесь аллюзия на юродивого Василия Блаженного, впоследствии канонизированного. Возможно, всё проще — из анекдота:

Исайя — среди упоминаемых по традициям Церкви имён архангелов Исайи нет. В Библии архангелом непосредственно назван только лишь Михаил (Послание Иуды:9). Известен пророк Исайя из Ветхого Завета.
Серафимы — от древнеевр. «сараф» (ивр. שָׂרָף, śārāf, множественное число — שְׂרָפִים, śərāfîm) — пылающие, горящие и др. В ангельской иерархии Серафимы стоят на высшей ступени из трёх, архангелы и ангелы на низшей.
Тормозок — взятая с собой на работу или в дорогу еда (из шахт. жарг.)
Русь — по одной из версий название «Русь» произошло от названия того племени (руси) Рюрика с братьями (есть гипотеза, что «братья» — ошибка переводчика), по другим — племя «русь» было в числе пригласивших варягов на княжение.
Парадигма — совокупность фундаментальных, основополагающих установок и правил.
Пути начальства… неисповедимы — перефразированное крылатое выражение «Пути господни неисповедимы», в свою очередь происходящее из Нового Завета (Послание апостола Павла к Римлянам, 11:33: «О бездна богатства и премудрости и ведения Божия! как непостижимы судьбы Его и неисследимы пути Его!»)

Комментарий к сцене первой
варяги — в русских летописях собирательное обозначение скандинавских народов. В наше время — специалисты (обычно руководители), приходящие в организацию со стороны, приглашённые для помощи, усиления чего-либо.
Врагу не сдается наш гордый варяг — цитата из одноименной песни на стихи Рудольфа Грейнца в переводе Е.М. Студенской (1904г), посвященной подвигу крейсера «Варяг» и канонерской лодки «Кореец»:

Гусли — древний русский щипковый струнный музыкальный инструмент.
Земля наша богата… — искажённая цитата из «Истории государства Российского от Гостомысла до Тимашева» А. К. Толстого:

в свою очередь являющаяся цитатой из «Повести временных лет»:

Показательно, что словосочетание «наряда нет», означающее «нет власти, управления», преобразовалось в «нет порядка».
Тезисы — кратко сформулированные основные положения, главные мысли, например, доклада.
экстенсивное — когда развитие обеспечивается за счет истощения, а не воспроизводства ресурсов (увеличением площадей, числа работников и т.п.) Противоположно интенсивному, при котором развитие и рост обеспечиваются совершенствованием технологий.
Рюрик — согласно русским летописям, варяг, основатель княжеской (впоследствии — царской) династии Рюриковичей.
Сморчок — буквально, съедобный гриб с морщинистой шляпкой. Здесь, человек неприглядной внешности (жарг.).
Страна советов — исходное значение: СССР, Советская страна, руководящими органами которой формально были Советы разного уровня. Получило второе, ироническое прочтение — «страна, где каждый советует, но ничего не делает»
Лет примерно семьсот — с 1533 г. (номинально с трёх лет) по 1584 г. Русью правил государь, великий князь московский и всея Руси (кроме 1575—1576), а с 1547 г. первый венчанный царь всея Руси Иоанн IV Васильевич, прозванный Грозным, как и его дед Иван III.
Погонялово — прозвище (жарг.)

Комментарий к сцене второй
сермяжная — здесь: простонародная, крестьянская, примитивная, убогая. Происходит от названия сермяги — толстого грубого сукна ручной работы из шерсти домашней выделки, из которого изготавливали крестьянскую одежду.
Тициан, Вечеллио — (итал. Tiziano Vecellio, 1488-1576), величайший итальянский живописец эпохи Возрождения. Писал картины на библейские и мифологические сюжеты, портреты.
Боттичелли, Сандро — (итал. Sandro Botticelli, настоящее имя Алессандро ди Мариано ди Ванни Филипапи, 1445-1510) — великий итальянский живописец, представитель флорентийской школы живописи.
Коперник, Николай — (польск. Mikołaj Kopernik, 1473-1543) — польский астроном, математик, механик. Автор гелиоцентрической системы мира, описанной им в труде «О вращении небесных сфер», положивший начало первой научной революции.
Изба курная — (иначе, черная) с печью без трубы, дым при топке печи наполняет дом и выходит в волоковое оконце под крышей или в открытые двери. В СССР встречались еще в 70-х годах ХХ века.
гой еси — характерная для устного народного творчества приветственно-величальная формула в значении «будь жив!», «будь здоров!». Встречается, например, в былинах («Ой ты гой еси, добрый молодец!»).
Хоть каплю жалости храня… — фраза из письма Татьяны к Онегину (А.С.Пушкин? «Евгений Онегин»):

Петр Великий (Петр I, 1672-1725) — Петр Алексеевич Романов, Государь, Царь и Великий Князь всея Руси, правил с 1689г, с 1721 г — первый Император Всероссийский. Известен, в числе прочего, масштабными реформами, направленными на модернизацию страны.

Комментарий к сцене третьей
Меншиков, Александр Данилович (1673-1729) — сподвижник и фаворит Петра I, государственный и военный деятель, первый генерал-губернатор Петербурга.
Редут — укрепление для круговой обороны, часто земляное.
По сусалам — по щекам, в челюсть, по морде.
Людишек не жалей — распространено мнение, что при строительстве Петербурга погибло очень много людей. Однако, по имеющимся данным, смертность на строительстве не превышала обычной для того времени — 6-8% в год, что подтверждается и отсутствием массовых захоронений того периода.
Окно в Европу — сравнение основания Петербурга с «окном в Европу» использовал А.С. Пушкин в «Медном всаднике»:

бороды побрить — Петр вел борьбу с внешними проявлениями традиционного образа русской жизни — наиболее известен запрет носить бороды.
Четвертовать — способ смертной казни, при котором осужденному сначала отрубали руки и ноги, и лишь затем голову.
Колесовать — способ смертной казни, получивший регулярное применение при Петре I. Осужденному перебивали или ломали все крупные кости тела, привязывали к колесу и, подняв колесо на шест, оставляли осужденного умирать лицом к небу.
Спросите меня, как — слоган обрел популярность в 90-х годах благодаря значкам распространителей пищевых добавок «Гербалайф»: «Хочешь похудеть? Спроси меня, как!»
шарман — (франц. charmant) — прелестно, очаровательно, восхитительно
Живота лишить — лишить жизни, казнить. Живот — жизнь (устар.)
не сыпь мне соль на рану… — цитата из песни Вячеслава Добрынина на стихи Симона Осиашвили

не везет мне в смерти — повезет в любви — повторяющаяся строка куплетов песни Булата Окуджавы на музыку Исаака Шварца «Госпожа Удача» для фильма «Белое солнце пустыни»:

Кассандра — в греческой мифологии дочь троянского царя Приама, одарённая даром прорицания, мрачным пророчествам которой никто не верил.
Александр II (1818-1881) — Император всероссийский, Царь польский и Великий князь финляндский. Проводил крупные реформы, самая известная — отмена крепостного права в 1861г. Вошел в историю с прозвищем Освободитель. Погиб в результате шестого по счету покушения — первая бомба повредила карету, вторая взорвалась у ног Александра, когда он вернулся к месту взрыва.
Николай II (1868-1918) — последний Император Всероссийский. Правление было богато историческими событиями: русско-японская война, революция 1905 года, Перая мировая война и, наконец, Октябрьский переворот, положивший конец российскому самодержавию, а затем и самому Императору (см. ниже)
Распутин, Григорий Ефимович (1869-1916) — крестьянин села Покровское Тобольской губернии. В начале 1900х годов приобрел в высшем свете Петербурга репутацию «старца», «целителя», «божьего человека». Имел большое влияние на царскую семью, активно вмешивался в политику.

Комментарий к сцене четвёртой: Кабинет Ленина
Кант, Иммануил (нем. Immanuel Kant, 1724-1804) — немецкий философ-метафизик, родоначальник немецкой классической философии.
критикует чистый разум — главный философский труд Иммануила Канта «Критика чистого разума» считается одной из наиболее фундаментальных работ в истории философии.
Карл Маркс (нем. Karl Heinrich Marx, 1818-1883) — немецкий философ и общественный деятель. В своих работах сформулировал диалектический и исторический материализм, теорию прибавочной стоимости, теорию классовой борьбы. Ленин использовал теории Маркса в своей политической борьбе.
Каин — библейский персонаж, убивший из зависти своего брата Авеля. Имя стало нарицательным для людей, способных на подлость и предательство.
Вор — здесь слово применено в устаревшем значении — «бунтовщик», «государственный преступник» (до XVIII века примерно).
царя убил — Николай II, его семья и приближенные были расстреляны в 1918 г. в Екатеринбурге. Среди историков нет единого мнения о роли в этом расстреле высшего руководства коммунистов в лице, прежде всего, Ленина и Свердлова.
Надюшей — Крупская, Надежна Константиновна (1869-1939) — российская революционерка, жена Ленина.
Бздю (перен.) — боюсь, трушу.
меньшевистский — здесь: проникнутый меньшевистской идеологией. Оказавшиеся после раскола на 2-м съезде РСДРП в 1903 г. в большинстве сторонники Ленина в дальнейшем получили название «большевики», оставшиеся стали именоваться «меньшевиками». После взятия большевиками власти в 1917 г. термин «меньшевик» стал негативным политическим ярлыком. Меньшевизм критиковался Лениным за мягкость, соглашательство, отрицание диктатуры пролетариата, революционного террора ("Меньшевики стремятся убить марксизм посредством мягкости" (В.И.Ленин, том XVIII, стр. 251)).
ходок — в старой России простой человек, обычно крестьянин, пришедший из глубинки к руководству с прошением. Широко известна картина «Ходоки у Ленина» художника В.А.Серова. В мюзикле в произношении Лениным созвучно с «хот-дог».
концы(устар.) — расстояния
мироеды(устар.) — зажиточные крестьяне, обиравшие тем или иным способом не столь успешных своих соседей (т.н. «мир», общину). Они же «кулаки»
Интеллигенция — говно — намёк на высказывание Ленина в письме Горькому: «…интеллигентиков, лакеев капитала, мнящих себя мозгом нации. На деле это не мозг, а говно».
лишь рабочие — по теории Маркса, сжато изложенной в «Манифесте коммунистической партии» именно беднейшие слои рабочих, пролетариат, являются движущей силой коммунистической революции: «Из всех классов, которые противостоят теперь буржуазии, только пролетариат представляет собой действительно революционный класс»
Часть человечества придется расстрелять — по Марксу, революционное насилие над угнетателями пролетариата, т.н. диктатура пролетариата есть абсолютно необходимое условие успешности революции. Это положение развито и применено Лениным на практике.
хуже Каутского — Каутский, Карл (нем. Karl Kautsky, 1854-1938) — немецкий экономист, историк и публицист, теоретик классического марксизма. В своей работе «Пролетарская революция и ренегат Каутский» Ленин полемизирует с Каутским, обвиняя его в извращении теории Маркса и хода революции в России.
Как обустроить Русь — аллюзия на на эссе Александра Солженицына «Как нам обустроить Россию», написанное в 1990 году и содержащее размышления о путях возрождения страны после конца «коммунистического периода».
митинг на заводе Михельсона — 30 августа 1918 г., после выступления Ленина на митинге в гранатном цехе завода Михельсона, на него было совершено покушение — Фанни Каплан (настоящее имя Фейга Ройдман) дважды ранила его выстрелами из браунинга.
гегемон (др.-греч. ἡγεμών — вожатый, проводник, руководитель, наставник) — здесь, пролетариат, рабочий класс. Гегемония пролетариата в революции — одна из основных идей марксизма-ленинизма.
На земле весь род людской… — перепев знаменитых куплетов (арии) Мефистофеля из оперы Шарля Гуно «Фауст». Русский текст либретто в переводе Петра Калашникова. Чекисты поют под музыку Гуно:

ВВП — сокращение, состоящее из начальных букв имени, отчества и фамилии Президента РФ Владимира Владимировича Путина, на момент написания песни (и комментария) находящегося у власти фактически третий срок.

Комментарий к сцене четвёртой: Трасса Сочи — Владивосток
на «Ладе-лимузин» — периодически то тем, то другим руководителем провозглашается идея пересадки руководства на продукцию отечественного автопрома. В.Путин лично опробовал трассу Чита-Хабаровск летом 2010 на машине «Лада Калина Спорт».
по трассе Сочи-Владивосток — намёк на два нашумевших события —  во Владивостоке, на острове Русский в январе 2013 открылся саммит АТЭС, а в Сочи зимой 2014 прошла зимняя Олимпиада. Оба события потребовали масштабной организационной и строительной подготовки, сопровождались скандальными происшествиями и долгое время не сходили с экранов и страниц прессы.
еще 47 депутатов — примерно с 2010 г участились случаи лишения неприкосновенности и, соответственно, мандатов депутатов Государственной Думы РФ.
Засупонин — «лошадиная» фамилия из одноименного рассказа А.П.Чехова.
Бацилла — здесь качественное калорийное питание, преимущественно жиры (из лагерно-воровского жаргона 30-х годов XX века). Вообще, многозначное сленговое слово.
еще 15 журавлей — в рамках проекта «Полет надежды» в сентябре 2012 г. В.Путин лично на мотодельтаплане в качестве вожака вел за собой стаю стерхов. Такая методика используется для перевода стаи на новое место зимовки.
из Мюнхена — возможно, упомянут как один из потенциальных центров вещания «вражеских голосов» — во времена холодной войны в Мюнхене располагалась штаб-квартира радио «Радио «Свобода»», которая вела пропагандистское вещание на СССР, предоставляя эфир, в том числе, и диссидентам.
спустило колесо — во время вышеупомянутой поездки по трассе Чита-Хабаровск на «Лада Калина Спорт» В.Путин однажды действительно остановил машину из-за постороннего скрежета. Как выяснилось, звук издавали камни, застрявшие между диском и шиной при движении по гравийному участку дороги.
Плохой конец заранее отброшен… — цитата из финального монолога Актёра пьесы-параболы Б.Брехта «Добрый человек из Сычуани» («Добрый человек из Сезуана» в русском переводе Е.Ионовой и Ю.Юзовского. Стихи в переводе Бориса Слуцкого». В 1963 году пьесу Брехта в том же переводе поставил Юрий Любимов со студентами Щукинского училища, — в 1964 году с этого спектакля началась история любимовской «Таганки»):

Как я рад, как я рад, Что поеду в Ленинград… — изменённая цитата из сказки «Бармалей» К.И.Чуковского:

И для Лёшки, и для Ксюшки… И для Миши, для Платоши — предположительно «пострадавшие от ВВП» Алексей Навальный, Ксения Собчак, Михаил Ходорковский и Платон Лебедев.